سازمان غذا و دارو مدعی است که گمرک ایران بدون دریافت و اخذ مجوز از وزارت بهداشت اقدام به صدور مجوز ورود برخی از اقلام دارویی به گمرکات کرده است که این امر منجر به انباشت دارو در گمرکات در شرایط نگهداری نامطلوب شده است و ترخیص این کالاها بدون تائید وزارت بهداشت منجر به مخاطره افتادن سلامت هم میهنان خواهد شد.

معاون فنی گمرک نیز در نامه ای به این ادعا واکنش نشان داده و اسنادی در این زمینه نیز منتشر شده است.