رژیم اسرائیل از حضور و نفوذ در جمهورى آذربایجان اهداف خاصى دارد که به گفته حامد خسروشاهى، پژوهشگر مسائل قفقاز در اندیشکده جریان، یکى از مهمترین این اهداف به زعم تل آویو، محاصره ایران در آن سوى مرزهایش است.
همچنین هرگونه درگیرى احتمالى بین ایران و جمهورى آذربایجان، مطلوب اسرائیل است.